作为中国中世纪以来最负盛名的哲学家，朱熹的学术思想虽然具有较浓的理性主义色彩，不过陈荣捷先生亦曾指出：“朱子实一最虔敬而富有宗教热诚之人”（《朱子之宗教实践》），其有关鬼神与魂魄大量的或哲理化或神秘主义的理论演绎就是例子。当前学界对朱熹的鬼神观已有较充分的讨论，对其魂魄观念却关注不多。

　　尽管《论语》里说“子不语怪力乱神”，但据《礼记·中庸》记载，孔子也曾对鬼神的形态、功能等做过较详细的解说：

　　子曰：“鬼神之为德，其盛矣乎！视之而弗见，听之而弗闻，体物而不可遗。使天下之人齐明盛服，以承祭祀，洋洋乎如在其上，如在其左右。《诗》曰：‘神之格思，不可度思！矧可射思！’夫微之显，诚之不可掩如此夫。”

　　在孔子看来，鬼神无声无形，人难以耳闻目睹其存在，然而鬼神又随处皆能发显其盛“德”，使天下之人对之祭拜不已。朱熹在《中庸章句》中对孔子所言鬼神的形态与功效评价说：“鬼神无形与声，然物之终始，莫非阴阳合散之所为，是其为物之体，而物所不能遗也。”朱熹认为，自然万物的产生与消亡这一终始过程全由阴阳之气聚散而成；然鬼神乃理气合构所生，是阴阳二气中之灵秀者，因此，世上无一物中无气，亦无一物中无鬼神。对于人而言，“洋洋乎如在其上，如在其左右”的鬼神亦在人体之中，并且是构成人的身形与“思虑营为”功能的主体。《礼记·礼运》道：“故人者，其天地之德，阴阳之交，鬼神之会，五行之秀气也。”朱熹便称赞“人者，鬼神之会”一说“说得好”（《朱子语类》卷八十七）。所以，当门人叶贺孙问：“鬼神便是精神魂魄。如何？”朱熹便回答说：人身的言笑思虑功能与天地自然的风雨雷电等气象变化，都是缘于同样的天地阴阳之气的感应与聚合，这便是鬼神之功。天地宇宙是一个有机整体，人是这一有机体中的重要一分子，在物理构成方面人与天地万物相应相通，鬼神之盛“德”在天地之间和人体之内的运行表现也是一致的，故此人体“内外均无非天地阴阳之气”。而人体中的鬼神又即“精神魂魄”（《朱子语类》卷三）。那么，鬼神与魂魄之间究竟是什么关系呢？朱熹明确指出：“精气就物而言，魂魄就人而言，鬼神离乎人而言。”（《朱子语类》卷六十三）精气为所有事物所共有，因而从本质上说，鬼神与魂魄均为精气之流行；二者的区别则在于：魂魄仅是对应于人而言，鬼神则超越于人，并无专指。

　　此外，据《礼记·祭义》记载，孔子的弟子宰我问鬼神究竟为何物？孔子答道：“气也者，神之盛也。魄也者，鬼之盛也。”其中的“气”与“魄”，郑玄注曰：“气，谓嘘吸出入者也。耳目之聪明为魄。”（此处的“气”便是魂，而《礼记》中本就有“魂气”一说，如“魂气归于天，形魄归于地”，又曾引孔子之言曰：“若魂气则无不之也，无不之也。”）孔颖达则进一步疏解了上述孔子关于鬼神气（魂）魄的话：

　　“气，谓嘘吸出入也”者，谓气在口嘘吸出入，此气之体无性识也。但性识依此气而生，有气则有识，无气则无识，则识从气生，性则神出入也。故人之精灵而谓之神。云“耳目聪明为魄”者，魄，体也。若无耳目形体，不得为聪明，故云“耳目聪明为魄”。